Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SALL4Q9UJQ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL4Q9UJQ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL4Q9UJQ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms