Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGEF1Q9UJ41 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGEF1Q9UJ41 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
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