Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPA4Q9UI42 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPA4Q9UI42 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms