Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASIC3Q9UHC3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASIC3Q9UHC3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms