Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPARGC1AQ9UBK2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms