Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GALPQ9UBC7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GALPQ9UBC7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GALPQ9UBC7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms