Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3BQ9UBC3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNMT3BQ9UBC3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3BQ9UBC3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms