Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
CC2D2AQ9P2K1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CC2D2AQ9P2K1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
CC2D2AQ9P2K1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms