Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABRACLQ9P1F3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ABRACLQ9P1F3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ABRACLQ9P1F3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ABRACLQ9P1F3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ABRACLQ9P1F3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ABRACLQ9P1F3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ABRACLQ9P1F3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABRACLQ9P1F3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABRACLQ9P1F3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ABRACLQ9P1F3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms