Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCMF1Q9P0J7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms