Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMCD1Q9NZU5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMCD1Q9NZU5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms