Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms