Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKIRAS1Q9NYS0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms