Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDND1Q9NY35 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDND1Q9NY35 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDND1Q9NY35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms