Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PGPEP1Q9NXJ5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms