Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CWC25Q9NXE8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CWC25Q9NXE8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms