Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLE1Q9NVX2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NLE1Q9NVX2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLE1Q9NVX2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms