Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3EQ9NVU0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR3EQ9NVU0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR3EQ9NVU0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms