Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBCCD1Q9NVR7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBCCD1Q9NVR7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBCCD1Q9NVR7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms