Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SETD4Q9NVD3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD4Q9NVD3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD4Q9NVD3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms