Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM30AQ9NV96 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM30AQ9NV96 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms