Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCF3Q9NUQ8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCF3Q9NUQ8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms