Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZCCHC3Q9NUD5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZCCHC3Q9NUD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZCCHC3Q9NUD5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms