Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOMER3Q9NSC5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOMER3Q9NSC5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms