Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL1Q9NSC2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SALL1Q9NSC2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL1Q9NSC2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms