Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM7SF3Q9NS93 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM7SF3Q9NS93 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM7SF3Q9NS93 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms