Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPHNQ9NQX3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPHNQ9NQX3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms