Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC31BQ9NQW1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC31BQ9NQW1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms