Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BRD7Q9NPI1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BRD7Q9NPI1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms