Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC4Q9NPG8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC4Q9NPG8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZDHHC4Q9NPG8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC4Q9NPG8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC4Q9NPG8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC4Q9NPG8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC4Q9NPG8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC4Q9NPG8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC4Q9NPG8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZDHHC4Q9NPG8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZDHHC4Q9NPG8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDHHC4Q9NPG8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms