Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPB41L5Q9HCM4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPB41L5Q9HCM4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41L5Q9HCM4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms