Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC4Q9HBW1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC4Q9HBW1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC4Q9HBW1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms