Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM27Q9HBJ8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM27Q9HBJ8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms