Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EBF2Q9HAK2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF2Q9HAK2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms