Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNDIG1Q9H7V2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNDIG1Q9H7V2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNDIG1Q9H7V2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms