Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCAF1Q9H7N4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCAF1Q9H7N4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCAF1Q9H7N4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF1Q9H7N4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 912 ms