Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC134Q9H6E4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC134Q9H6E4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC134Q9H6E4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC134Q9H6E4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC134Q9H6E4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC134Q9H6E4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC134Q9H6E4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC134Q9H6E4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC134Q9H6E4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC134Q9H6E4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC134Q9H6E4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC134Q9H6E4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC134Q9H6E4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms