Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLMPQ9H6B4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLMPQ9H6B4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms