Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMG9Q9H0W8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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