Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB17Q9H0T7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB17Q9H0T7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB17Q9H0T7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB17Q9H0T7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB17Q9H0T7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB17Q9H0T7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB17Q9H0T7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB17Q9H0T7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB17Q9H0T7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB17Q9H0T7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB17Q9H0T7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB17Q9H0T7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB17Q9H0T7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms