Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
POLR2J2Q9GZM3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2J2Q9GZM3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms