Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC39A8Q9C0K1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms