Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AMBRA1Q9C0C7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AMBRA1Q9C0C7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms