Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRRCC1Q9C099 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRCC1Q9C099 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms