Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABARAPL3Q9BY60 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 708 ms