Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RSPO3Q9BXY4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSPO3Q9BXY4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms