Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUSAP1Q9BXS6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUSAP1Q9BXS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms