Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRRTQ9BXP5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRRTQ9BXP5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms