Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGPP1Q9BX95 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGPP1Q9BX95 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms