Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF7Q9BWX1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms