Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FNDC11Q9BVV2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FNDC11Q9BVV2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNDC11Q9BVV2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms